گونه‌های شدید و خفیف ویروس پیچیدگی برگ گوجه‌فرنگی مورد هدف miRNA‌‌های متفاوتی از میزبان قرار‌ می‌گیرند

جمینی‌ویروس‌ها یکی از مهمترین عوامل محدود کننده‌ کشت گوجه‌فرنگی در سراسر جهان محسوب ‌می‌شوند. ویروس‌ پیچیدگی‌ برگ‌ گوجه‌فرنگی Tomato leaf curl virus (ToLCV) یکی از اعضای خانواده جمینی‌ویریده می‌باشد که دارای گونه‌های با‌ بیماریزایی شدید‌ و‌ خفیف است. مشخص ‌شده ‌است که برخی ‌از miRNAهای میزبان قادرند ویروس‌های حیوانی را هدف ‌قرار ‌داده و مانع از استقرار آنها شوند. تاکنون هیچ گزارشی مبتنی بر روش‌های آزمایشگاهی، در‌ مورد ویروس‌های گیاهی ارائه ‌نشده‌ است. با‌ این‌وجود براساس تحلیل‌های بیوانفورماتیکی، ویروس‌های گیاهی نیز می‌توانند به‌وسیله miRNAهای میزبان هدف ‌قرار ‌گیرند. در این تحقیق، با‌ استفاده‌ از روش‌های بیوانفورماتیکی امکان اتصال miRNAهای مختلف میزبان به گونه‌های شدید و خفیف ToLCV بررسی شده‌است. نتایج نشان‌داد miR156 امکان اتصال به هر‌ دو گونه‌ ToLCV را دارد. گونه‌ خفیف ویروس، مورد ‌هدف miR157، miR168، miR396 و miR166 قرار‌ می‌گیرد درحالی که گونه‌ شدید، ToLCV-Au، توسط گروه دیگری از miRNAها شامل miR159، miR319 و miR403 هدف ‌قرار‌ می‌گیرد. تمام miRNAها بجز miR156a با نواحی کد کننده‌ ژنوم ویروس‌ها جفت می‌شوند. در مورد ویروس ToLCV-Au، miRNA319c به ژن V1 متصل می شود. miR159c و miR403 به ترتیب به ژن های C1 و C3 متصل می شوند. ژن C1 گونه‌ ToLCV-Ir، توسط miR157a و miR156h و ژن V2 آن نیز در محل های مختلف مورد هدف miRNAها شامل miR168b، miR396b و miR166i قرار می‌گیرد. نقش احتمالی miRNAهای به‌دست‌ آمده در تولید علائم شدید و خفیف توسط هر ‌دو گونه بحث ‌شده ‌است.